Segmentasi Citra Digital Objek Hasil Pengamatan In Situ Localization Gen gfp pada Tanaman Transforman

Firas Atqiya, Nisa Ihsani, Muhammad Rizqi Sholahuddin, Fenny Martha Dwivany, Sony Suhandono

Abstract


Penelitian berbasis biomolekuler membutuhkan beragam penggunaan perangkat lunak pengolah data. Salah satunya yaitu kebutuhan perangkat lunak yang mampu mengolah data citra digital pada proses segmentasi warna. Dalam penelitian biomolekuler, segmentasi warna dapat digunakan untuk menganalisis pendaran warna hijau sebagai hasil ekspresi gen gfp. Gen pelapor ini banyak digunakan dalam proses rekayasa genetik tumbuhan maupun hewan yaitu: memonitor ekspresi gen, in situ localization, biosensor, physiological indicators, dan studi interaksi protein. Sinar UV pada panjang gelombang eksitasi 450-490 nm dapat diserap dan diemisikan oleh molekul protein GFP sebagai warna hijau. Adanya pendaran hijau tersebut diharapkan hanya muncul sebagai penanda terekspresinya gen gfp. Namun demikian, pada sampel tumbuhan terkandung senyawa metabolit sekunder yang dapat menyerap dan mengemisikan sinar UV sebagai warna hijau. Adanya warna hijau selain hasil ekspresi gen gfp ini tentunya dapat menyebabkan hasil analisis in situ localization menjadi bias. Oleh karena itu, diperlukan teknik pengolahan citra digital yang mampu memilah warna hijau hasil ekspresi gen gfp dan warna hijau dari emisi senyawa metabolit tumbuhan. Tujuan  penelitian  ini  adalah untuk memisahkan objek hasil ekspresi gen gfp pada citra digital jagung transforman dengan warna hijau yang diemisikan oleh senyawa metabolit sekunder jagung menggunakan pengolahan citra digital. Proses yang digunakan adalah color filtering, thresholding, dan Canny edge detection. Hasil penelitian yang diperoleh berupa citra yang mengandung citra objek hasil ekspresi gen gfp yang telah tersegmentasi pada sayatan melintang akar jagung transforman.


Keywords


gfp; color filtering; canny edge; transformasi

References


Chalfie, M., Tu, Y., Euskirchen, G., Ward, W. W., dan Prasher, D. C. 1994. Green Fluorescent Protein as A Marker for Gene Expression. Science. 263(5148): 802–805

Gonzalez, R.C. & Woods, R.E. 2002. Digital Image Processing Second Edition. New Jersey: Prentice Hall

Hidayatullah, Priyanto. 2017. Pengolahan Citra Digital: Teori dan Aplikasi Nyata. Bandung: Penerbit Informatka

Kumar, A., & Pal, D. 2016. Green Fluorescent Protein and Their Applications in Advance Research 1 2. Research Journal of Applied Sciences, Engineering and Technology. 01(1): 42–46

Lukac, R., Plataniotis, K.N., Venetsanopoulos, A.N.2008. Color Image Filtering and Enhancement. Boston:Springer

McAndrew, A.2004.An Introduction to Digital Image Processing with Matlab Notes for SCM2511 Image Processing 1. School of Computer Science and Mathematics Victoria University of Technology

Munir, R.2004.Pengolahan Citra Digital dengan Pendekatan Algoritmik. Bandung: Informatika

Remington, S. J. 2011. Green Fluorescent Protein: A perspective. Protein Science. 20(9): 1509–1519

Roshchina, V. V. 2008. Fluorescing World of Plant Secreting Cells. Boca Raton: CRC Press

Tsien, R. Y. 1998. The Green Fluorescent Protein. Annual Review of Biochemistry. 67(1): 509–544




DOI: https://doi.org/10.17509/edsence.v1i2.21575

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Jurnal Pendidikan Multimedia ( p-ISSN:2685-2489 | e-ISSN:2685-2535) published by Program Studi Pendidikan Multimedia, Kampus UPI di Cibiru, Universitas Pendidikan Indonesia

Indexed by:

    

Visitor Number : StatCounter - Free Web Tracker and Counter View My Stats

p-ISSN:2685-2489 | e-ISSN:2685-2535